Библиотеки, написанные на Nextflow
rnaseq
Конвейер анализа секвенирования РНК с использованием STAR, RSEM, HISAT2 или Salmon с подсчетом генов/изоформ и тщательным контролем качества.
- 646
- MIT
sarek
Конвейер анализа для обнаружения зародышевых или соматических вариантов (предварительная обработка, вызов вариантов и аннотация) из WGS / целевого секвенирования.
- 256
- MIT
configs
Файлы конфигурации, используемые для определения параметров, характерных для вычислительных сред в разных учреждениях (по nf-core).
- 71
- MIT